华东师范大学学报(自然科学版) ›› 2014, Vol. 2014 ›› Issue (4): 102-112.
祝静静1, 黎万顺2, 高 虹1, 徐 通2, 鲍秋颖1, 郑永祥3, 周德敏3, 夏 钢1
ZHU Jing-jing1, LI Wan-shun2, GAO Hong1, XU Tong2, BAO Qiu-ying1, ZHENG Yong-xiang3, ZHOU De-min3, XIA Gang1
摘要: 脆蛇是一种类似于蛇但是又具有蜥蜴的特征的爬行动物, 这些矛盾的特性与脆蛇的系统发育分类学有密切的关系. 脆蛇在传统中药中也有很多治疗作用. 基于这些方面, 本研究利用高通量测序方法对脆蛇胃肠道的转录组序列进行检测, 组装和注释. 最终获得4.6~Gbp高质量的数据, 组装获得58 959个单一的基因, 其中35 708(60.56{\%})个单一基因与数据库的基因相匹配. 为了确定脆蛇与蛇和蜥蜴的同源进化关系, 对同源基因家族和系统进化树进行了分析, 结果显示脆蛇的转录组序列更接近于蛇而不是蜥蜴. 除此之外还鉴定了10 613 cSSR标签, 其中\linebreak1 644个标签根据严格的标准能够用至少一个引物获得. 本研究第一次揭示了脆蛇胃肠道的转录组序列, 确定其在系统发育学上的定位. 这些序列和标签为脆蛇的研究提供了重要的资源.
中图分类号: