流域大型梯级水库群, 夏末秋初蓄水, 来年枯季放水, 季节性改变了入海径流量, 会影响河口盐水入侵和淡水资源利用. 收集了长江流域大型梯级水库有效库容和南水北调工程跨流域调水的量值, 利用改进的河口海岸三维数值模式ECOM-si, 模拟和分析了长江流域重大工程对河口盐水入侵和淡水资源的影响. 截至2020年和2035年, 长江流域中上游已建和将建大型水库有效库容分别为706.11和943.88亿m3, 蓄水期9、10月间平均径流量分别减少13398和17909 m3/s. 基于大通实测水文站1950—2020年实测月平均径流量, 考虑截至2020年和2035年流域重大工程对径流量的调节, 给出了平均水文年和特枯水文年8—10月的月平均径流量. 数值模拟结果表明, 截至2020年和2035年流域梯级水库9—10月蓄水, 径流量下降, 导致盐水入侵加剧. 在平均水文年, 南支水源地4个水库9—10月所有时间均能取到淡水. 在特枯水文年, 9—10月东风西沙、太仓、陈行和青草沙水库取水口连续不宜取水天数截至2020年分别为28.75、24.99、29.63和37.47 d, 到2035年分别为46.53、44.18、47.56和50.75 d. 夏末秋初特枯和平均水文年情况下流域水库蓄水期间遇到强北风作用, 均会显著影响长江口水源地取水. 对于特枯水文年, 流域水库群应减少蓄水量, 甚至应该放水, 以保障长江口淡水资源的安全.